ศ.ดร.นิธิ เอียวศรีวงศ์, รศ.ดร.เกษียร เตชะพีระ, รศ.ดร.อรรถจักร สัตยานุรักษ์, รศ.สายชล สัตยานุรักษ์, รศ.วารุณี ภูริสินสิทธิ์,รศ.สมเกียรติ ตั้งนโม, ผศ.สมชาย ปรีชาศิลปกุล, ผศ.เกรียงศักดิ์ เชษฐพัฒนวนิช,
อ.ชัชวาล ปุญปัน, อ.ไพสิฐ พาณิชย์กุล, อ.สุชาดา จักรพิสุทธิ์,อ.นัทมน คงเจริญ, อ.พิกุล อิทธิหิรัญวงศ์ และ อ.ชำนาญ จันทร์เรือง ร่วมลงชื่อคัดค้านการทำความตกลงความร่วมมือทางเศรษฐกิจไทย-ญี่ปุ่น(JTEPA) ด้วยเหตุแห่งความไม่ชอบธรรมหลายประการ และให้เหตุผลว่าตลอดเวลาที่ผ่านมาเกี่ยวกับการทำความตกลงความร่วมมือดังกล่าว ไม่มีการเปิดเผยข้อมูลอย่างเป็นทางการโดยภาครัฐหรือผู้รับผิดชอบเกี่ยวกับสาระสำคัญของข้อตกลงนั้น จึงทำให้เกิดความไม่โปร่งใส

เนื้อความระบุอีกว่าตลอดเวลาที่ผ่านมา ไม่ปรากฏว่าประชาชนได้มีส่วนร่วมในการตัดสินใจอย่างกว้างขวาง
โดยเฉพาะประเด็นการเปิดเสรีให้ญี่ปุ่นเข้ามาจดสิทธิบัตรจุลชีพ หรือเปิดโอกาสให้ญี่ปุ่นประกาศคุ้มครองพันธุ์พืชใหม่ อันจะเกิดผลกระทบอย่างมากมายและร้ายแรง รวมถึงประเด็นการแย่งใช้บริการสาธารณสุขไทย และการแพร่ขยะอันตรายและของเสียจากญี่ปุ่น

ประการต่อมา หลังจากการทำความตกลงความร่วมมือทางเศรษฐกิจไทย-ญี่ปุ่น(JTEPA)แล้ว หากมีข้อผิดพลาดประการใด  รัฐบาลชั่วคราวชุดนี้จะไม่มีส่วนในความรับผิด(accoutability)ใดๆ

ประเด็นที่สำคัญที่สุด คณาจารย์มหาวิทยาลัยเที่ยงคืนเห็นว่า รัฐบาลที่มาจากการรัฐประหารซึ่งเป็นรัฐบาลชั่วคราว และมีนโยบายส่งเสริมเศรษฐกิจพอเพียง มีความขัดแย้งในเชิงนโยบายกับที่ประกาศไว้
ด้วยเหตุข้างต้นทั้งหมด รัฐบาลชุดนี้จึงไม่มีความชอบธรรมที่จะลงนามข้อตกลงระหว่างประเทศใดๆ
ที่จะมีผลผูกมัดต่อประชาชนและสังคมไทยในอนาคต

คณาจารย์มหาวิทยาลัยเที่ยงคืน ยังได้เชิญชวนประชาชนทุกภาคส่วนร่วมมือกับกลุ่ม FTA Watch ให้ระงับการเจรจาไว้ก่อน จนกว่าทุกประเด็นจะได้รับการพิจารณาอย่างกว้างขวาง รอบคอบ และโปร่งใส
ภายใต้บรรยากาศประชาธิปไตยและรัฐบาลที่เป็นประชาธิปไตยอย่างแท้จริง